Три новых исследования дают основания полагать, что Z-геном более распространён среди бактериофагов, чем считалось ранее

Три команды учёных независимо друг от друга обнаружили свидетельства того, что Z-геном более распространён у бактериофагов, чем считалось ранее. Все три группы использовали множество техник определения генома, чтобы идентифицировать некоторые пути, которые приводят к развитию Z-генома у бактериофагов — вирусов, поражающих бактерии. Первая команда состояла из исследователей из нескольких лабораторий Китая и одного из Сингапура, вторая базировалась во Франции, а третья была международной. Все три команды опубликовали свои результаты в журнале Science. Майкл Гроум и Фаррен Айзекс из Йельского университета также опубликовали обзор работ всех трёх команд в разделе Perspectives того же журнала.

phages

Геномная ДНК большинства живых существ имеет четыре азотистых основания: аденин, тимин, цитозин и гуанин, — обозначаемые ATCG соответственно. Но ещё в 1977 году учёные узнали, что у многих бактериофагов алфавит немного другой, в котором вместо аденина добавляется диаминопурин, который затем был обозначен как Z. После этого открытия считалось, что такой алфавит очень редок, поэтому он не очень хорошо изучался, так что мало известно о том, как бактериофаги функционируют без аденина в их геноме. В этом новом исследовании все три команды решили узнать больше о Z-нуклеотиде и том, как она работает у бактериофагов.

В первом исследовании учёные изучали состав фага бактерий рода Vibrio и обнаружили, что в нём больше нуклеотида Z, чем A. Они также описали структуру фермента, кодируемого геном, похожим на известный ген PURA, который они назвали PURZ. Они затем показали, что он функционирует очень похоже на фермент Pur-α, но с заменой аденина на Z. Вторая команда обнаружила гены, которые кодируют ДНК-полимеразы, которые выбирают диаминопурин, а не аденин. И третья команда обнаружила фермент, который играет главную роль в собирании ДНК из составных частей. Они также обнаружили, что он работает как шлюз, отсеивая нуклеотиды A и добавляя вместо них Z.

Работа этих трёх команд даёт основания полагать, что Z-геном более распространён среди бактериофагов, чем считалось ранее. Дальнейшие исследования могут привести к новым улучшенным способам борьбы с бактериальными инфекциями — один из исследуемых вирусов поражает в том числе возбудителя холеры.

Перевод Антон Меньшенин, редактор Елена Королёва.
Исследования:
1. Yan Zhou et al. A widespread pathway for substitution of adenine by diaminopurine in phage genomes, Science (2021). DOI: 10.1126/science.abe4882
2. Dona Sleiman et al. A third purine biosynthetic pathway encoded by aminoadenine-based viral DNA genomes, Science (2021). DOI: 10.1126/science.abe6494
3. Valerie Pezo et al. Noncanonical DNA polymerization by aminoadenine-based siphoviruses, Science (2021). DOI: 10.1126/science.abe6542

Источник — https://phys.org/news/2021-04-z-genome-widespread-bacteria-invading-viruses-thought.html

Добавить комментарий

Заполните поля или щелкните по значку, чтобы оставить свой комментарий:

Логотип WordPress.com

Для комментария используется ваша учётная запись WordPress.com. Выход /  Изменить )

Google photo

Для комментария используется ваша учётная запись Google. Выход /  Изменить )

Фотография Twitter

Для комментария используется ваша учётная запись Twitter. Выход /  Изменить )

Фотография Facebook

Для комментария используется ваша учётная запись Facebook. Выход /  Изменить )

Connecting to %s